پروفسور آروناکس با ندلند که صیاد نهنگ بود و دوستی دیگر،همراه میشود تا با کشتی تحقیقاتی به جستجوی هیولایی در زیر آب که عامل غرق شدن کشتیهاست،بروند اما کشتی در اثر برخورد با آن موجود سخت آسیب میبیند و پروفسور آروناکس و همراهانش از زیردریایی ناتیلوس متعلق به کاپیتان «نیمو” قهرمان داستان ژول ورن، سر در میآورند. آنها با ناتیلوس سفر میکنند و شگفتیهای دنیای زیر آب را میبینند و در همین حین با کاپیتان نیمو، ناخدا و مالک ناتیلوس آشنا میشوند. پروفسور درعین حال که کاپیتان را بسیار تحسین میکند، اما اخلاقیات او را رد میکند و برخورد او با مسائل دنیا را درست نمی داند. پروفسور و همراهانش فکر میکنند چون از راز ناخدا نیمو آگاه شدهاند در ناتیلوس اسیر شده و دیگر نمیتوانند به دنیای روی آب باز گردند، آنها حاضر نیستند تا آخر عمر در ناتیلوس بمانند و خیلی سعی دارند فرار کنند اما غیر ممکن است.